省军民融合办公室副主任和武装部都是省级机关的领导岗位，但是它们的性质、职责、待遇和发展前景有所不同。具体的比较如下：性质方面，省军民融合办公室是工作部门，属于系统，主要负责推进经济、科技、教育、人才等各领域军民融合，更深层次更大范围把国防和现代化建设与经济社会发展结合起来，全面推进可持续发展的专职机构。武装部是省工作部门，属于系统，主要负责组织领导全省国防动员、后备力量建设、征兵工作、军事教育、双拥工作等。职责方面，省军民融合办公室副主任主要协助主任负责军民融合办的日常管理工作，分管一定的业务范围，如法规、科技创新、人才培养等。武装部主要负责武装部的全面工作，统筹协调各项业务工作，如国防动员、后备力量建设、征兵工作等。