伯杰氏系统4类，35群。《伯杰氏细菌鉴定手册(第九版)》将原核微生物分为35群，归纳为四大类（或四个门）：第一类，具细胞壁的革兰氏阴性真细菌。第二类，具细胞壁的革兰氏阳性真细菌。第三类，无细胞壁的真细菌。第四类，古细菌。