1、定义不同：上皮组织主要由上皮细胞组成，覆盖在机体或脏器的表面，保护组织主要由植物的表皮细胞组成，在植物上。2、功能不同：上皮组织具有保护、吸收、分泌和排泄等功能，位于身体不同部位和器官的上皮具有不同的功能，保护组织的主要功能是保护植物免受外部环境的损害，如干旱、病虫害等。