1、毛细管堵塞或断裂：用水冲洗毛细管，观察是否有水流出，若无水流出，拆下卡盒检查毛细管两端和窗口是否断裂，若毛细管没断裂，用水反向高压冲洗，缓冲液需过滤，将样品过滤或离心去除其中的颗粒。2、缓冲液中有气泡产生或区带中样品析出：将缓冲液超声脱气，有此现象发生，是区带中样品析出，降低样品浓度，在缓冲液中溶解度不高的样品，在缓冲液中加入添加剂。