不需要。软著申请是一项网络申请，一般需要在线填写申请表，上传软件的著作权证明材料。对于个人的申请来说，只需在提交申请时输入填写好自己的姓名、身份证号等个人信息即可，不需要进行实体的手印认证。所以软著合作协议签字不需要按手印。