1、故事不同：《黑铁的神秘列车》主要讲述了柯南和灰原哀的故事，而《黑铁的鱼影》则描述了柯南等人前往北海道的“雪音”度假村参加钓鱼比赛的故事。2、受众群众不同：《黑铁的鱼影》融入了一些轻小说的元素，使其更加符合年轻人的阅读口味。而《黑铁的神秘列车》则更依赖于推理和解谜来吸引读者。