1、地理位置：哈尔滨医科大学本部位于哈尔滨市，是黑龙江的省会，而大庆校区则位于黑龙江的地级市大庆。大城市通常具有更多的就业机会和资源。2、师资力量：哈尔滨医科大学本部拥有更多的高水平学科和师资力量，具有更强的教学和科研实力。而大庆校区是哈尔滨医科大学在双城办学模式下的产物，由于历史较短，大庆校区在师资力量的积累和培养方面相较于本部有所不足。