扣手续费。根据中国银行业监督管理委员会的规定，银行卡跨行取款的手续费由取款行收取。因此，在使用工行卡在建行ATM上取款时，手续费由建行收取。具体来说，如果使用工行卡在建行ATM上取款，每笔取款金额的不同，会收取一定比例的手续费，而这个手续费的具体计算方法会根据取款金额的多少有所区别。