1、医保基金不够用：我国的医保基金面临较大的压力，将甲流疫苗纳入医保报销范围，会增加医保基金的负担，导致医保基金不够用。2、疫苗管理难度大：甲流疫苗是一种预防性疫苗，需要针对不同人群进行分类管理，对于儿童、老年人、慢性病患者特定人群，需要进行接种前的健康评估和禁忌症筛查，管理难度较大，将甲流疫苗纳入医保报销范围，会增加管理难度和成本。