109家。根据查询南方财富网官网得知：南京市是中国东部地区的一个重要城市，也是中国的经济中心之一。南京市共有上市公司109家。南京市的上市公司涵盖了多个行业，包括制造业、金融业、房地产业、批发和零售业等。