1、藻类分布不同：同层地衣的藻细胞散乱分布，而异层地衣的藻细胞则是分层分布。2、结构不同：同层地衣缺乏皮层或只有上皮层，而异层地衣有上皮层、藻胞层、髓层和下皮层组成。