给员工支付的房租该计入管理费用、销售费用等科目会计科目，会计分录主要分公司从外面租用或者房子归属公司所有租给员工两种情况。1、公司从外面租用，给员工支付的房租会计科目如下：借：管理费用-职工福利费贷银行存款等。2、如果房子是公司自己所有，直接租给员工，给员工支付的房租会计科目如下：借生产成本管理费用在建工程等，贷：应付职工薪酬-非货币福利，借：应付职工薪酬-非货币福利。