1、恩格尔曼的实验只能说明叶绿体在光合作用中起到了重要的作用，但并不能确定它们是唯一进行光合作用的地方。2、恩格尔曼使用了显微镜观察水棉细胞，并通过染色剂标记出叶绿体，然后观察到氧气和淀粉颗粒在叶绿体中产生。这种方法无法直接证明光合作用发生在叶绿体内部。