1、用途不同：低电渗琼脂糖常用于配制核酸分析检测用凝胶，例如：用于DNA或RNA电泳的琼脂糖凝胶等；普通琼脂糖常作为制作培养基。2、特点不同：低电渗琼脂糖具有低电渗、凝胶强度高、染色背景低、品质稳定等特点；普通琼脂糖具有凝固性、稳定性、不易被人体消化吸收等特点。