个税系统监测疑点主要针对的是应发工资。应发工资是员工根据劳动法和企业签订的劳动合同，在一定的工作周期内应获得的报酬。这包括基本工资、奖金、津贴、加班费等。个税系统通过对应发工资的监测，可以识别出可能存在的税收问题，例如收入是否合法、是否已按照税收缴纳了个人所得税等。如果监测到疑点，个税系统会提醒企业或员工进行核实和调整，以确保税收的合法性和准确性。