概念不同。特殊目的公司是指为了特定目的而设立的公司实体；境外投资企业是指在国内以外的国家或地区注册并运营的企业。类型不同。特殊目的公司包括有限责任公司和股份有限公司；境外投资企业包括外商投资企业、港澳台商投资企业、股份制企业、合伙企业、个人独资企业等。