每100克牛奶含有3.5克蛋白质。如果要计算1.25千克牛奶中含有多少克蛋白质，首先需要将1.25千克转换为克，即1250克。然后，用1250克除以100克，得到12.5。接下来，将12.5乘以每100克牛奶的蛋白质含量3.5克，得到43.75克。因此，1.25千克的牛奶中含有43.75克蛋白质。