1、与电子政务系统的兼容性问题：WPS和MicrosoftOffice是两个不同的办公软件套件，在某些情况下，二者之间的文件格式会存在兼容性问题，导致在WPS中创建或编辑的Office文档在电子政务系统中无法正确显示或打开。2、安全性考虑：电子政务系统涉及敏感信息或受控信息，因此需要保证使用的软件是经过授权和受信任的。尽管WPS是一款广泛使用的办公软件，但是不被电子政务系统信任或接受，因其安全性和可靠性没有经过特定的验证。