在蛋白质溶液中加入碱和少量的硫酸铜，就能生成紫红色铜的络合物，显示蛋白质分子中所含肽键数目越多，颜色越深。其中，双缩脲反应是一种典型的颜色反应，双缩脲是由2分子尿素，失去1分子氨后的缩合产物。多肽分子中含有许多和双缩脲结构相似的肽键－CO－NH－，因此，任何蛋白质或者蛋白质水解中间产物都有双缩脲反应。蛋白质黄色反应也是颜色反应的一种，某些蛋白质跟浓作用呈黄色，再以氨处理又变成橙色。这种反应的蛋白质分子一般都存在苯环。而蛋白质跟茚三酮反应，则是一种紫色的颜色反应，可以用来鉴别蛋白质。颜色反应不仅限于蛋白质，还原性糖类与斐林试剂也可以发生颜色反应，生成砖红色的沉淀。但斐林试剂需要现配现用。