雾化杯里放12小时的生理盐水是可以使用的。雾化治疗是一种有效的呼吸道疾病治疗方法，其中包括使用生理盐水进行雾化。生理盐水，又称无菌生理盐水，是0.9%的氯化钠注射液，放至12小时不会影响效果。