胚胎发育期间的异常也是导致马蹄内翻足的一个重要因素。Bohm提出，足部畸形状态在胚胎3个月时较为明显，包括下垂、内收和旋后（内翻）。从第4个月起，足部开始调整至中和旋转位，跖骨轻度内收，足部逐渐接近正常位置。若发育过程中出现任何障碍，足部将保持在早期的畸形状态。宫内因素同样不可忽视。胎儿在子宫内的体位不佳，足时间受压，处于内收、后跟内翻、踝部下垂位，会导致小腿后侧和内侧肌肉缩短，内侧关节囊增厚，进一步加重足部畸形。环境因素同样对马蹄内翻足的发生有一定影响。研究表明，某些环境因素，如Duraswami在鸡胚内注射胰岛素，可导致马蹄内翻足畸形。在肢体发育的关键时刻，缺氧也可能引起该病。Stewart指出，在日本患者中，由于存在蹬坐于内翻足上的习惯，发病率特别高。