1、来源不同：DNA文库是从生物体的基因组DNA中提取出来的，包含了该生物体的全部基因信息。而cDNA文库则是从生物体的mRNA反转录成cDNA后构建的，只包含了该生物体表达的基因信息。2、组成不同：DNA文库中的DNA片段是随机断裂的，长度不一，没有特定的功能。而cDNA文库中的cDNA片段是由特定的mRNA反转录而来的，具有特定的功能。