昭通高速公路投资集团公司下属有6个分公司。昭通高速公路投资集团公司下设了6个经营的子公司，8个公路管理处、20个在建和拟建公路项目建设指挥部、3个养护中心、1个机电维护中心、1个工程检测中心。