擅自克扣员工工资属违法之举。根据我国劳动法规，工资应按月付与劳动者个人，禁止无故拖欠或克扣。如因员工给企业带来经济损失且相关规章有规定，则最多可扣员工当月工资的20%，剩余金额必须不低于当地最低工资标准。反之，公司无端变相扣薪，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司补发所扣部分，甚至追讨经济赔偿。