主角巴斯是一位矿工机师的徒弟，有一天，他在工作中发现一个亮晶晶的东西正在慢慢地下落。他飞也似的跑过去，发现是一个女孩子，她被一团蓝光包围，从天上飘下来。第二天，希达在巴斯的房间里醒来，发现房里有一张“天空之城拉普达”的照片，这是巴斯的父亲冒着生命的危险拍到的。父亲在郁郁寡欢中去世，巴斯发誓一定要证实天空之城的存在。嗅觉灵敏的海盗很快就找上门来。巴斯和希达经历了令人眼花缭乱的追捕与逃跑，最终在众目睽睽之下掉入矿井。希达的飞行石再次发光，令他们安全飘落。矿井中，飞行石和井下的矿石发生共鸣，这里曾是开采飞行石原料的地方。传说只有拉普达人才掌握着提炼飞行石的技术。