1、深度不同：高等代数的知识更加详细系统透彻，更偏重理论。线性代数一般是给非数学专业的但需要数学知识的专业开设的，所以更注重应用的，所以重点涉及应用性强的部分。2、内容不同：线性代数是高等代数中的部分，内容比高等代数简单，是理工类非数学专业学生的必修科目，而高等代数通常是数学专业的学生的专业基础课，现在一些和数学相关很强的专业也学习高等代数比如信息类及统计类专业。