与学校沟通。在南京民办学校就读的学生决定放弃该学校，需要进行一些统筹工作，可以采取与学校沟通方法，与民办学校的教务处或行政部门联系，并表达自己决定放弃就读的意愿。对方将指导自己行后续操作，并提供必要的文件和表格。