2个半小时。这是直飞的情况就是从南京以最短的距离直接飞到日本东京，日本位于我国的邻国，如果是转机飞向日本东京，时间就不一定了，看飞到哪里转机，绕的越远自然飞行的时间就越长，而且转机还要转机等待时间，远超2个小时。