没有区别。华藏寺因境内有建于明代的华藏寺而且得名，在当地老百姓的习惯叫法中，华藏寺不仅仅指具体的寺院，而更常用的是表示天祝县城，所以天祝县和华藏寺没有区别。天祝县是中华人民共和国成立后第一个实行民族区域自治的地区，属甘肃省武威市。