不合法，如果职工是因工受伤，医疗期内全额支付工资。终上所述，无论是哪种情况的请假，用人单位都不能扣除员工双倍工资，请假3天扣双倍工资的是个不合法法行为。法律依据。《中华人民共和国劳动法》 第五十一条 法定节假日用人单位应当依法支付工资，即折算日工资、小时工资时不剔除国家规定的11天法定节假日。