不会扣工资。1.机关事业单位伤病残人员，不符合退休、退职条件，经医院证明不能坚持正常工作，所在单位批准修养的，其病假期间的工资发放比例为。2.工作人员病假在2个月以内的，发给原工资假超过2个月的，从第3个月起，工作年限不满10年的，发给本人工资的90%，工作年限满10年的，工资照发。3.病假超过6个月的，从第7个月起，工作年限不满10年的，发给本人工资的70%，工作年限满10年的，发给本人工资的80%。工作人员在病休假期间，继续享受所在单位的生活福利。4.工作人员病假超过6个月以上的时间不计算连续工龄。病休人员要求恢复工作的，需出具医院关于病愈的证明。5.恢复工作后，因工作过于劳累旧病复发，或另患其他疾病需要继续休养的，其病假时间可以重新计算，否则其恢复工作前后的病假时间连续计算。