甲类药品和乙类药品在医保报销上最大的区别就在于报销比例上。对于甲类药品，医保的报销比例是100%的；而乙类药品，各地有15%的调整权，由各地根据自身基金的承受能力，对乙类药品设定一定的自付比例，再按照医疗保险的规定给付，一般乙类药品的报销比例为80%。法律依据。《中华人民共和国社会保险法》 第二十四条 国家建立和完善新型农村合作医疗制度。新型农村合作医疗的管理办法，由规定。