要。开发利用自然资源，应当合理规划，有计划地开采，避免对环境造成破坏，在公路建设过程中，需要穿越湖泊保护区，应当进行环境影响评价，并按照规定办理相关手续，因此环评公路穿越湖泊保护区要办手续。