1、学科建设：皖江工学院在学科建设方面表现优秀，拥有多个硕士点和博士点，而马鞍山学院在这方面相对较弱。2、科研实力：皖江工学院的科研实力较强，拥有较多的科研项目和科研成果，而马鞍山学院的科研实力普通，其成果不如皖江工学院多。