肾结石手术农村合作医疗能报销60%。肾结石手术农村合作医疗可以报销60%-70%的费用。凡参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65，10001-18000元补偿70。