二者都属于高效消毒剂，都能杀灭常见的细菌、病毒等病原微生物。但84消毒液价格相对便宜、性质相对稳定、比较容易获取。但在室内空气消毒时，因过氧乙酸挥发性更强，所以它更容易杀灭空气中的病原体，所以过氧乙酸在室内消毒效果好。