1、观察的不同。核磁共振灌注成像是建立在流动效应基础上成像方法，观察的是分子的微观运动；核磁共振观察的是血液流动的宏观流动。2、检查的不同。核磁共振灌注成像多用于检查影响脑内灌注的疾病，常见的有缺血性脑病、脑肿瘤等；核磁共振检查可以用于检查中枢神经系统、五官、胸部、腹部、肌肉骨骼系统的病变。