1952年，全国高等学校进行院系调整，几所医学院合并成立了上海第二医学院。1985年，学院更名上海第二医科大学。1997年，学校成功进入“211工程”立项范围。2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，成立了由教育部和上海市重点共建的上海交通大学医学院，成为“985工程”高校之一。详情。