中国科学技术大学苏州研究院档次高。中科大苏州研究院和中科大其他学院属于平级关系，主要以硕士生和博士生为主，是档次高的研究院，中科大位于安徽省合肥市，由中国科学院直属，直管副部级建制，位列世界一流大学建设高校A类、211工程、985工程。所以中国科学技术大学苏州研究院档次高。