商铺租赁税需要去当地税务局缴纳，商铺租赁合同在房产管理部门备案。根据《商品房屋租赁管理办法》的规定，房屋租赁合同订立后三十日内，房屋租赁当事人应当到租赁房屋所在地直辖市、市、县建设房地产主管部门办理房屋租赁登记备案。