1、针对对象不同：甲基硫菌灵主要用于治疗小麦上的白粉病，乙蒜素则主要用于治疗小麦上的赤霉病和叶锈病。2、作用机制不同：甲基硫菌灵是一种杀菌剂，主要通过抑制病原菌的细胞壁合成和代谢来达到杀菌的效果。而乙蒜素则是一种天然植物提取物，主要通过抑制病原菌的生长和繁殖来达到防治的效果。