以色列驻华大使馆关闭原因是该国财政部和外交部之间的矛盾。根据查询相关资料信息，导致以色列关闭所有外交领事馆的原因是因为该国财政部和外交部之间的矛盾，财政部决定撤销在7月份与外交部达成的共识，单方面撤销了外交部驻外人员的津贴免税的有关协定。