股东已经清算撤股，还有费用未报销的，直接作废。根据我国公司法规定，股东在撤股之后与公司已经没有所有权上的关系了，而其所有的报销费用，均需在撤股之前完成，没有完成的视为放弃，所以股东已经清算撤股，还有费用未报销的，直接作废。