南京农业大学和南京工业大学相比较南京农业大学好。南京农业大学是国家双一流，211工程，985工程优势学科创新平台重点建设高校，在全国排名54，而南京工业大学是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校，既不是211也不是985，在全国排名第93，因此南京农业大学好。