南京图书馆全年无休，每日的常规开放时间为上午9：00开始。其中，一楼的中文报纸阅览室、电子阅览室周一至周五从9：00到21：00开放，双休日和法定节假日则调整为9：00至17：30。少儿书刊借阅室的工作日时间是周一至周五的12：30至17：30，寒暑假、双休日和法定节假日也延长到17：30。其他服务窗口同样遵循这个时间表，直至17：30后，读者需要从南门进入图书馆。