水石和玉石的主要区别在于成分、外观、密度和价值等方面。水石主要由碳酸钙和二氧化硅组成，外观通透温润，密度较轻，价值较低。玉石主要由硅酸盐矿物组成，质地坚硬细腻，高光泽度和高密度，价值较高。