1、形状不同：瓜蒌子为扁平椭圆形，外观呈现棕褐色，十分坚硬。吊瓜子像西瓜籽，比西瓜籽更饱满，颜色灰暗，两头是开口的。2、生长环境不同：瓜蒌子主要分布在河北、河南、安徽等地的丘陵、山地，喜温暖湿润的气候。吊瓜子生长在江苏、浙江、安徽等地，喜阴湿的环境，通常生长在树林下或灌丛中。3、功效不同：瓜蒌子具有润肺化痰、滑肠通便的功效，可以用于燥咳痰黏、肠燥便秘等的治疗。吊瓜子具有抗菌、抗癌、防癌以及健胃，化痰、治痰和清肺等作用。