一般来说，烟草公司的档位是根据上一年度的卷烟订货销售情况，由电脑自动生成的。如果在查处到窜码烟后，烟草公司会对这种违法行为进行处罚，这可能会影响到信誉度和档位的升降。然而，具体是否会影响升档还要看窜码烟的具体情况以及烟草公司的内部规定。如需了解更多信息，建议咨询烟草公司工作人员。