1、罪刑法定原则和保障原则：邓元贞案中，邓元贞被指控犯有“寻衅滋事罪”，但是相关法律规定中对于“寻衅滋事罪”的定义和标准并不明确，因此在具体应用时容易出现歧义和主观判断。同时，邓元贞在被拘留期间被多次虐待和殴打，严重侵犯了她的。2、机关追查犯罪和依法保护的平衡：邓元贞案中，机关在追查犯罪的过程中采取了强制措施和刑讯逼供等手段，导致被拘留人员受到侵害。在这种情况下，如何平衡机关追查犯罪和依法保护的关系，是一个需要考虑的问题。