分公司印花税是由分公司自己缴纳的，而不是由总公司缴纳。因为印花税是由国家税务总局规定的，是一种地方税种，需要在当地税务机关进行申报和缴纳。因此，分公司需要根据当地税务机关的要求，按照规定的税率和申报时间，自行申报和缴纳印花税。